Экшен «Стартрек» предлагает игрокам выступить в роли культовых героев «Звездного пути» — капитана Кирка и коммандера Спока — и вместе отправиться навстречу приключениям. События игры происходят в альтернативной вселенной «Звездного пути», начало которой положил полнометражный фильм режиссера Дж. Дж. Абрамса, вышедший на экраны в 2009 году.

Некогда изгнанная темная раса могущественных и загадочных созданий, названных Призраками, готова вернуться в пределы известной нам вселенной. Ключ к их освобождению — три легендарные Кровавые Сферы, способные обуздать невиданную доселе мощь и вызволить расу из вечного заточения в межпространственном туннеле.